У земній корі Водопроникні породи (пухкі і пористі) і водотривкі (монолітні) зазвичай чергуються один з одним. Тому підземні води можуть перебувати на різній глибині, між різними пластами. Розрізняють грунтові та міжпластові підземні води.
Грунтові води можуть залягати на різній глибині. Це залежить від земної кори місцевості і клімату. Так на рівнинах з холодним і вологим кліматом грунтові води можуть бути у самої поверхні, утворюючи болота. У спекотному і сухому кліматі грунтові води залягають глибоко. Також глибина знаходження грунтових вод може змінюватися в залежності від сезону. Так в помірному поясі навесні грунтові води знаходяться вище, а влітку – глибше.
У пустелях підземні води залягають дуже глибоко. Так під Сахарою вони знаходяться на глибині більше 150 м.
Коли в зниженнях рельєфу грунтові води виходять на поверхню, вони утворюють джерела і ключі.
Міжпластові підземні води залягають глибше грунтових. Іноді люди добувають їх, пробуривая свердловини. Якщо свердловина пробурена в увігнутих областях гірських порід, то оскільки вода тут знаходиться під тиском, вона виривається під тиском у вигляді фонтану. Такі води називають артезіанськими.
Багато підземні води містять розчинені в них речовини і гази. Такі води називають мінеральними.
З глибиною збільшується температура земної кори. Тому води, поточні на великих глибинах, теплі або гарячі.
Буває, що шар земної кори, прямо під яким розташовується водоносний шар, складається з розчинних порід (вапняки та ін.). Підземні води легко розмивають ці шари і утворюються порожнечі і печери. Утворюються так звані карсти. У них можуть розростатися сталактити (ростуть вниз) і сталагміти (ростуть вгору).