На початку Другої світової війни Греція оголосила про нейтралітет. 28 жовтня 1940 фашистська Італія пред’явила Афінам ультиматум, зажадавши вільного допуску своїх військ на грецьку територію, поступки ряду важливих стратегічних пунктів і морських баз. Ультиматум був відкинутий. Італійські війська вторглися на територію Греції, але були зупинені, а потім витіснені в Албанію. 6 квітня 1941 року в війну вступила Німеччина. Незважаючи на запеклий опір, який вчинила грецької армією і висадилися в Греції британським експедиційним корпусом (бої на північному кордоні у оборонної «лінії Метаксаса», битва за Крит), до червня 1941 року вся територія країни була окупована. Король Георг II з урядом і залишками армії евакуювалися в Єгипет. Грецькі війська продовжили боротьбу в складі британських сил.
На території Греції, зайнятої німецькими, італійськими та болгарськими військами, розгорнулося масштабне рух опору, два головних крила якого – ідеологічно чужих і часом відкрито ворогують один з одним – становили монархісти і комуністи (до 1944 року – близько 20 тисяч і 70 тисяч бійців відповідно) . До осені 1943 року партизани звільнили до третини території країни. У вересні – жовтні 1944 року німецьке командування вивело свої війська з Греції, побоюючись, що наступ Червоної Армії відріже їх на Балканах. За час війни безповоротні втрати Греції склали 400 тисяч чоловік.
У жовтні 1944 року в Греції висадилися британські війська, з еміграції повернувся уряд. Відмова комуністів підкоритися наказу про роззброєння своїх підрозділів привів в грудні 1944 року до збройних зіткнень в Афінах з британцями. Варкізское угоду 12 лютого 1945 року про легалізацію комуністичних політичних організацій в обмін на здачу зброї також виявилося неміцним, і восени 1946 року гостре ідеологічне протистояння переросло в громадянську війну, в якій Великобританія, а з 1947 року і США відповідно до доктрини Г. Трумена надавали антикомуністичним силам масштабну економічну і військову допомогу. У 1949 році комуністи припинили опір.