В даний час з царства грибів в окремі царства протистів і хромистого винесені грибоподібних організми, так як використання сучасних технологій і методів геносистематики і молекулярної генетики дозволило визначити межі царства справжніх грибів.
Відмінними їх ознаками є:
- гетеротрофность;
- всі гриби – еукаріоти;
- спосіб харчування – осмотрофное (всмоктуючий). Травлення – зовнішнє. Міцелій виділяє в зовнішнє середовище ферменти, які розкладають великі молекули, а потім всмоктує вийшов «бульйон»;
- їх тілом є міцелій, що володіє необмеженим ростом, але зростання здійснюється тільки на кінцях гіф в довжину, без потовщення гифов. При цьому міцелій повністю занурений в субстрат для зручності всмоктуючого харчування;
- у більшості грибів спороносні органи виносяться вгору, вище верхньої межі субстрату і утворюють плодові тіла;
- для забезпечення можливості всмоктування води і розчинених в ній речовин, гриби підтримують дуже високу внутрішньоклітинний тиск.
Будучи еукаріотамі, проте, гриби сильно відрізняються від інших організмів на клітинному рівні:
- мають дуже маленькі розміри хромосом і примітивний геном, схожий на Прокаріотних;
- міцелій може не мати перегородок між клітинами або мати дуже великі пори, через які протопласт (цитоплазма з органоидами) перетікає з однієї в іншу;
- поділ клітин може відбуватися незалежно від поділу ядра, клітини часто багатоядерних.
Ядра також вільно переміщаються з клітки в клітку. Часто ядра, що знаходяться в одній клітці, містять різну генетичну інформацію;
- мають клітинну стінку з хітину;
- можуть синтезувати незамінну для тварин амінокислоту лізин.
Розмножуватися гриби можуть різними способами:
- Вегетативно – шматочками міцелію, брунькуванням (дріжджі), частинами міцелію, укладеними в своєрідні суперечки.
- Безстатевим розмноження – спорами (в тому числі шапинкових). Спори утворюються на пластинках або в трубочках капелюшки.
- Статевим – цей спосіб характерний для нижчих грибів. Після злиття гаплоїдних гамет, продукованих спеціальними виростами – антеридіями (чоловічі або оогоніями (жіночі) утворюється зигота. Вона покривається товстою оболонкою і після періоду спокою проростає.