Розвиток лімфоми

Дослідження лімфомогенеза має довгу історію і в даний час виявлено безліч клітинних генів, які беруть участь в тих чи інших процесах, що ведуть до злоякісного переродження лімфоїдної тканини. Лімфомогенез, як і інші форми канцерогенезу, є багатоетапним процесом. Одним з переконливих підтверджень цьому є експерименти на подвійних трансгенних мишах. Ці дослідження показали наявність синергізму між великим числом генів.

Одним з вірусних генів-кандидатів, який може бути відповідальний за HIV-асоційований лімфомогенез, є ген tat. Вище вже були наведені результати, отримані на трансгенних тварин, які підтверджують участь гена tat в лімфомогенезе. Одним з можливих механізмів дії гена tat є Tat-опосередкована індукція гена бета-полімерази, що змінює стабільність ДНК в HIV-асоційованих лімфомах. У HIV-асоційованих лімфомах виявили безліч клітинних генів, потенційно відповідальних за їх розвиток. Одним з таких генів є ген TCL1, детектувати за допомогою віднімає гібридизації.

З метою отримання більш повної картини молекулярного механізму HIV-індукованого лімфомогенеза нами була проведена серія експериментів з використанням методу віднімає гібридизації, що дозволяє ідентифікувати гени, експресія яких посилюється або придушується в лімфомах у HIV-інфікованих пацієнтів.

На першому етапі за допомогою віднімає гібридизації були досліджені популяції мРНК двох В-клітинних неходжкінських лімфом пацієнтів, інфікованих HIV-1: центробластная (CL) і імунобластні (IL) (за класифікацією KIEL). За класифікацією REAL обидві ці лімфоми відносяться до дифузним В-клітинним великоклітинною лімфомою (DLBCL). Для вивчення спектру генів, які посилюють свою експресію в цих лімфомах, були проведені віднімаються гібридизації з використанням кДНК, синтезованих на мРНК лімфомних клітин і нормальних лімфоцитів людини. Як трейсера при віднімає гібридизації служили лімфомних кДНК, а в якості драйвера кДНК нормальних лімфоцитів крові людини. Після отримання забраних бібліотек кДНК здійснювали їх двоетапний скринінг.

Приблизно 10% клонів кДНК, отриманих після вирахування, за даними подвійного диференціального скринінгу, представляли собою лімфомоспеціфіческіе кДНК. Після відбору специфічних для лімфом клонів ці кДНК частково секвенували і їх послідовності порівнювали з існуючими базами даних нуклеотидних послідовностей. В результаті проведеного аналізу було виявлено три типи клонів: (1) не мають гомології з нуклеотидними послідовностями, представленими в існуючих базах даних; (2) мають гомологію з клонованою раніше кДНК невідомої природи (EST) і (3) мають гомологію з описаними раніше генами. При порівнянні лімфомоспеціфіческіх генів CL і IL з’ясувалося, що серед них є як загальні, так і специфічні для окремих лімфом.

Далі, з метою більш повного аналізу спектру високоекспрессірующіхся генів в цих двох лімфомах людини і для доказу того, що виявлені нами відмінності в спектрі високоекспрессірующіхся генів є реальними, а не результатами обмежених можливостей використаного методу, була проведена додаткова віднімається гібридизація з використанням РНК CL як трейсера і РНК IL як драйвера.

Результати свідчать про те, що виявлені нами на першому етапі відмінності в спектрі високоекспрессірующіхся генів між двома типами лімфом дійсно мають місце. Крім цього, було виявлено ряд нових високоекспрессірующіхся в CL генів. Цікаво, що отримані нами дані з порівняльного аналізу CL і IL добре збіглися з результатами масштабного аналізу, проведеного одночасно з нами з використанням нової техніки на базі мікрочіпів. Виявлений нами підвищений рівень транскрипції генів в CL в порівнянні з IL, таких як онкогени set і a-myb, IL-4R, ТАР2, було виявлено для ряду DLBCL в результаті аналізу, проведеного з використанням мікрочіпів. Все лімфоми, в яких було виявлено підвищення експресії описаних нами генів, ставилися до великого підтипу DLBCL, що містять клітини, схожі з В-лімфоцитами центру розмноження. Ці дані є ще одним підтвердженням специфічності виявленого нами спектра генів, високоекспрессірующіхся в CL.

...
ПОДІЛИТИСЯ:

Дивіться також:
Обмін речовин і енергії